Musik mereka di penghujung 90an pun kental dengan alunan hardcore punk yang meghentak dan tajam.
Memasuki dekade 2000an, musik AFI perlahan mengurangi agresi ala hardcore punk dan memasukan unsur gothic rock dan nuansa teatrikal dalam lagu-lagunya.
Band ini kemudian meraih popularitas serupa dengan band-band seperti The Used dan My Chemical Romance, yang disebut-sebut berhasil mematangkan sound khas emo di era tersebut. (*)